原則上，法人稅的申告期限都是事業(yè)年度終了后的2個月以內，如事業(yè)年度為4月1日至3月31日的法人的申告期限則為5月31日。

納稅人：

法人稅的納稅人包括國內法人和外國法人。國內法人是指在日本國內設立總機構的法人；外國法人是指機構設在日本境外的法人。法人稅稅法規(guī)定，國內法人應就其境內外的全部所得繳納法人稅；外國法人只就其來源于日本境內的所得繳納法人稅。

課稅對象：

日本法人稅的課稅對象是企業(yè)的利潤所得。國內法人就經營所得（指企業(yè)從事各種經營行為的利潤所得）、清算所得（指企業(yè)在解散、合并時的清算所得）、退休年金基金（對按規(guī)定建立的退休年金基金產生的利息征收，由銀行、保險公司等代扣代繳）繳納法人稅。

外國法人來源于日本境內的所得共分為11類：經營活動及資產運用所得、提供勞務所得、不動產租賃所得、存款利息所得、股息所得、貸款利息所得、廣告所得、生命保險基金所得、外國企業(yè)風險準備金、從匿名組合等組織分得的所得、資產轉讓所得。

應納稅所得額為納稅人每一納稅年度的利潤總額減去費用后的余額。

法人稅應納稅額的計算公式為：

應納稅額 = 應納稅所得額 × 適用稅率

①股息的處理：實行法人之間分配股息扣除制度。法人A對法人B持股達25%以上、持續(xù)時間在6個月以上的，法人A從法人B取得的股息全額不征稅；持股低于25%時，取得的股息80%不征稅。

②向外國分支機構支付的特許權使用費：日本法人向外國分支機構支付的特許權使用費允許扣除，但是必須符合獨立公平交易價格的規(guī)定。對資本弱化公司而言，負有關聯(lián)公司債務的日本法人支付利息的可扣除部分受到限制。運用公式計算出的負債資產比例超過3：1時，不得扣除負債利息。

③固定資產折舊：納稅人可以選擇使用余額遞減法和直線法，殘值是購置成本的10%，網站服務器的使用年限為4年，稅法規(guī)定了不同種類固定資產的使用年限和使用上述兩種方法時的年折舊率。

④虧損結轉：法人合并、分立發(fā)生的經營虧損，可以向后結轉5年，即允許從今后5年內實現(xiàn)的利潤中抵扣（特殊情況允許結轉7年至10年），不論法人稅還是法人居民稅均不允許虧損向前結轉。

⑤準備金制度：稅法允許為今后可能發(fā)生的費用或損失列支的稅收制度。現(xiàn)行準備金包括：壞賬準備金、返銷品調整準備金、特別維修準備金、海外投資風險準備金和金屬礦山預防災害準備金。

⑥交際費扣除：從2003年起，對資本金在1億日元以下的法人，交際費列支標準為400萬日元，允許實際扣除90%。

⑦留存利潤征稅制度：為防止關聯(lián)公司內部過度使用節(jié)稅策略，日本規(guī)定了公司內部留成比例最高限額，對年度留存利潤超過規(guī)定扣除限額的部分，采用特別稅率征收。考慮到內部留成是中小企業(yè)的重要資金來源，因此對其超額留存利潤適用較低的三級累進稅率：對不超過3000萬日元的部分，稅率為10%；超過3000萬日元至1億日元的部分，稅率為15%；超過億日元的部分，稅率為20%。從2003年至2006年期間，對于自有資本比率低于50%的中小企業(yè)，停止適用留存利潤征稅制度。

⑧捐贈款扣除：用于振興科教文衛(wèi)或社會福利事業(yè)的捐贈款，允許全額扣除。慈善捐款的扣除比率為應納稅所得的1.25%或者實收資本的0.125%，但是，對外國分支機構的捐款則一概不予扣除。

⑨未向稅務機關提供收款人姓名、住址等信息資料的費用支出一概不能扣除。除了征收正常的法人稅和居民稅以外，對這類費用支出還將適用48.28%的特殊稅率征稅。

⑩2002引進母公司合并納稅制度：合并前母公司產生的虧損允許向后結轉5年，從企業(yè)重組后的年度應納稅所得額中抵扣。

日本法人稅實行自行納稅制度，法人稅的申報有藍色申報和普通申報兩種。藍色申報是指對于有較為健全的記賬憑證和會計制度，并能正確計算和繳納稅款的法人企業(yè)，經稅務批準，可使用藍色申報表進行納稅申報。實行藍色申報制度的法人，在虧損結轉、準備金的建立、固定資產折舊等方面，比普通法人享有較多的稅收優(yōu)惠。普通申報，亦稱白色申報，納稅人必須在事業(yè)年度終了后兩個月內向稅務機關提交納稅申報表并繳清稅款，逾期不繳稅款或申報不實、少繳法人稅稅款的，稅務機關可根據(jù)稅法的有關規(guī)定，給予處罰。 

根據(jù)法人的區(qū)分所定的稅率乘以所得金額來計算基本的法人稅額。另外，根據(jù)特殊的情況有加算特別課稅或減算稅額扣除等項目，加減后最終計算出應繳納的稅額。

具體的算式如下：

所得金額×稅率+特別課稅額-稅額扣除額-中間已繳納稅額=最終應繳稅額。

法人稅稅率：

15%- 23.20%，類似于國內的企業(yè)所得稅，應稅額以企業(yè)財稅年度利潤為基數(shù)，可以理解為交給國稅的企業(yè)所得稅部分。